NP³ MS Workflow - A Pipeline for LC-MS/MS Metabolomics Data Process and Analysis
O NP³ MS Workflow (v1.1.4) é uma coleção de scripts para melhorar agilizar a pesquisa em metabolômica untarget focada em descoberta de drogas com otimizações para produtos naturais.
É um procedimento automatizado para agrupar e quantificar os espectros MS² (MS/MS) associadas ao mesmo íon que foram eluídos em picos cromatográficos (MS1) concorrentes em uma coleção de amostras de experimentos LC-MS/MS.
Os possíveis resultados são:
- Tabela classificação de espectros candidatos responsáveis por hits observados em experimentos de bioatividade;
- Quantificação relativa de metabólitos presentes nas amostras;
- Grafo de redes moleculares para melhorar a análise e visualização dos resultados.
Tutorial em vídeo
- Tutorial 1: Brief introduction, 'Getting Started' section and a [M+H]+ analysis