Carregando imagens via OMERO.insight

O OMERO.insight é uma aplicação desktop que permite o gerenciamento e visualização de imagens armazenadas no servidor OMERO. Ele oferece uma interface gráfica amigável para navegar, visualizar e organizar suas imagens.

Instalando o OMERO.insight

Para realizar o envio das imagens à plataforma OMERO, é necessário instalar o programa OMERO.insight no computador que será utilizado para esse procedimento. O instalador está disponível em: https://www.openmicroscopy.org/omero/downloads/.

OMERO.insight download

Escolha a versão mais recente disponível para o seu sistema operacional.

Configurando o OMERO.insight

  1. Após a instalação, abra o OMERO.insight em seu computador e clique no ícone de ferramenta (🔧), localizado no canto superior direito da janela.
OMERO.insight interface
  1. Em seguida, clique no botão (➕) para adicionar um novo endereço de plataforma OMERO;
OMERO.insight add server
  1. Na janela "Add new server", digite o seguinte endereço omero-lnbio.cnpem.br e clique em “⏎ OK”;
OMERO.insight add server
  1. Selecione o endereço omero-lnbio.cnpem.br e clique em “Apply” (Figura 5b);
OMERO.insight select server

Transferindo imagens para o OMERO

Após configurar o OMERO do LNBio no OMERO.insight, utilize suas credenciais institucionais do CNPEM para fazer login.

OMERO.insight login
Se você é a Marie Skłodowska-Curie, o seu usuário institucional é marie.curie em “Username” e sua senha institucional em “Password”.

Após o login, você terá acesso à interface do OMERO.insight, onde poderá visualizar e gerenciar suas imagens.

OMERO.insight main interface

Para carregar novas imagens, siga os passos abaixo:

  1. Clique no menu "File" e selecione "Import..."
OMERO.insight import menu
  1. Na janela de importação, selecione os arquivos que deseja carregar para o OMERO, e clique em > para colocá-los na fila de transferência.
OMERO.insight add images
  1. Uma janela para definir o projeto de destino aparecerá. Selecione o projeto desejado ou crie um novo, e clique em "Add to the Queue".
OMERO.insight add to queue
  1. Ajuste as configurações de importação. Desmarque opção Override default File naming, e caso deseje acelerar o processo de transferência, ative todas as opções da área Import Speedup.
OMERO.insight select options
  1. Clique em "Import" para iniciar o processo de transferência das imagens para o OMERO.
OMERO.insight start import
  1. Durante a transferência, uma janela de progresso será exibida, indicando os arquivos que estão sendo transferidos para o OMERO.
OMERO.insight transfer progress
  1. Se a transferência for bem-sucedida, uma marcação verde (✔️) será exibido ao lado da aba ou no canto superior direito da tela inicial.
OMERO.insight transfer completed
  1. Após a conclusão da transferência, as imagens estarão disponíveis no menu de navegação no projeto definido no momento da importação.
OMERO.insight navigate to project

Caso não apareçam imediatamente, clique no ícone de “Refresh” (🔄) para atualizar as placas importadas pelo OMERO.insight.

OMERO.insight refresh