OMERO

Bem-vindo à documentação do repositório de bioimagens OMERO. Este guia foi criado para ajudar os administradores e usuários a entender como utilizar e gerenciar o sistema OMERO, que permite a visualização, organização, análise e compartilhamento de imagens de microscopia.

Acesso pelo navegador Browser Icons

Para acessar o OMERO, abra o seu navegador e digite o seguinte endereço na barra de endereços:

https://omero-lnbio.cnpem.br

Este site só estará disponível na rede interna. Para acessá-lo de fora do centro, utilize a VPN. Se não tiver acesso à VPN, entre em contato com o TIC.

Faça login com a sua senha institucional. Seu nome de usuário é a parte do seu e-mail antes do '@'.

Exemplo: Se você é a Marie Skłodowska-Curie (marie.curie@lnbio.cnpem.br), seu usuário é marie.curie.

OMERO.web @ Edge

Se o login for bem-sucedido, você verá a tela do webapp abaixo:

OMERO.web file viewer

Observações:

  • Os logins de usuários (marie.curie) e dados do Columbus estão sincronizados e acessíveis pela aplicação web;

  • Se este for seu primeiro acesso institucional, seu cadastro será criado automaticamente.

Acessando grupos

Após fazer login e acessar a página de visualização de arquivos, você verá no canto superior esquerdo um icone de duas pessoas (👥) indicando o grupo que está visualizando. Clique nele para listar todos grupos dos quais faz parte. Ao passar o mouse sobre um grupo, você verá os usuários inclusos.

OMERO.web group

Ao clicar em um usuário, você pode visualizar, anotar ou editar imagens, dependendo das permissões do grupo. Por padrão, apenas a visualização é permitida.

OMERO.web group