Aplicativos e Programas
No HPCC Marvin, os aplicativos e programas são disponibilizados principalmente por meio do sistema de módulos (Lmod), permitindo que os usuários carreguem e utilizem diferentes versões conforme suas necessidades. Eventualmente, alguns podem estar disponíveis fora deste padrão, quando há necessidades específicas ou limitações técnicas.
Para listar os módulos disponíveis, utilize o comando:
module avail
Para listar os módulos com a descrição, utilize:
module spider
Para carregar um módulo específico, use:
module load <nome>/<versão>
Quando múltiplas versões de um software estão disponíveis, uma delas é definida como padrão (indicada por
(D)).Para listar os módulos carregados na sua sessão, utilize:
module list
Para solicitar a instalação ou atualização de um aplicativo ou programa, registre um chamado [LNBio] Suporte EDB do Jira em HPCC Marvin: Aplicativos, Programas e Sistemas.
Bioimagens
Os programas e aplicativos relacionados à processamento e análise de imagens biológicas são:
Biologia Estrutural
Os programas e aplicativos relacionados à modelagem, dinâmica molecular, predição e análise estrutural de proteínas são:
Descoberta de fármacos (Drug Discovery)
Os programas e aplicativos relacionados à descoberta e desenvolvimento de fármacos são:
HiC
Os programas e aplicativos relacionados à análise, processamento e visualização de dados de interação cromossômica (Hi-C) são:
Microscopia Eletrônica
Os programas e aplicativos relacionados a processamento, análise e visualização de microscopia eletrônica são:
Ômicas
Os programas e aplicativos relacionados a processamento, análise e visualização de ômicas são: